Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf12Q8C8K3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf12Q8C8K3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms