Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe22Q8C6A8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms