Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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4933409G03RikQ8C5U0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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4933409G03RikQ8C5U0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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4933409G03RikQ8C5U0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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4933409G03RikQ8C5U0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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4933409G03RikQ8C5U0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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4933409G03RikQ8C5U0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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4933409G03RikQ8C5U0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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4933409G03RikQ8C5U0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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4933409G03RikQ8C5U0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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4933409G03RikQ8C5U0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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