Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc90bQ8C3X2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc90bQ8C3X2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc90bQ8C3X2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc90bQ8C3X2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc90bQ8C3X2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc90bQ8C3X2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc90bQ8C3X2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc90bQ8C3X2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms