Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssuh2Q8C3L1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms