Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Rapgef5Q8C0Q9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Rapgef5Q8C0Q9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Rapgef5Q8C0Q9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef5Q8C0Q9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Rapgef5Q8C0Q9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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