Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccser1Q8C0C4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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