Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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Cldn17Q8BXA6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Cldn17Q8BXA6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Cldn17Q8BXA6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Cldn17Q8BXA6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Cldn17Q8BXA6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn17Q8BXA6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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