Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Usp38Q8BW70 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp38Q8BW70 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp38Q8BW70 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp38Q8BW70 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp38Q8BW70 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Usp38Q8BW70 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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