Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Triml1Q8BVP1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms