Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN0

Ccdc122, Coiled-coil domain-containing protein 122, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc122Q8BVN0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc122Q8BVN0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc122Q8BVN0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms