Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod1Q8BVA4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod1Q8BVA4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms