Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms