Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Klhl38Q8BSF5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl38Q8BSF5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms