Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3Q8BRE0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3Q8BRE0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3Q8BRE0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3Q8BRE0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3Q8BRE0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3Q8BRE0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3Q8BRE0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3Q8BRE0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3Q8BRE0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3Q8BRE0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3Q8BRE0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3Q8BRE0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms