Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TicrrQ8BQ33 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TicrrQ8BQ33 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TicrrQ8BQ33 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TicrrQ8BQ33 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TicrrQ8BQ33 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TicrrQ8BQ33 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TicrrQ8BQ33 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TicrrQ8BQ33 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TicrrQ8BQ33 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TicrrQ8BQ33 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TicrrQ8BQ33 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms