Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms