Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga3Q8BMI3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms