Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dupd1Q8BK84 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Dupd1Q8BK84 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms