Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
D130040H23RikQ8BII3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D130040H23RikQ8BII3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms