Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp4f39Q8BGU0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms