Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Htatsf1Q8BGC0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Htatsf1Q8BGC0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms