Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sv2bQ8BG39 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sv2bQ8BG39 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms