Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srgap3Q812A2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap3Q812A2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms