Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4cQ811C2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms