Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChfrQ810L3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChfrQ810L3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChfrQ810L3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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