Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc27Q80YS5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms