Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kdm5bQ80Y84 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Kdm5bQ80Y84 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Kdm5bQ80Y84 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Kdm5bQ80Y84 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms