Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap1Q80UJ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms