Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otop3Q80UF9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms