Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3cQ80U95 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3cQ80U95 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3cQ80U95 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms