Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Avl9Q80U56 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Avl9Q80U56 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms