Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC42.26■■■■■ 4.36
NischQ80TM9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
NischQ80TM9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
NischQ80TM9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC42.13■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC42.12■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
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