Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc42bpbQ7TT50 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms