Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rexo1Q7TT28 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms