Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms