Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms