Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Dsg1bQ7TSF1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Dsg1bQ7TSF1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Dsg1bQ7TSF1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Dsg1bQ7TSF1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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