Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn1Q7TPR4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actn1Q7TPR4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn1Q7TPR4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn1Q7TPR4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn1Q7TPR4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms