Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prrc2bQ7TPM1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prrc2bQ7TPM1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms