Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno2Q7TNB8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms