Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shq1Q7TMX5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shq1Q7TMX5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms