Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tigd3Q7TM95 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tigd3Q7TM95 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms