Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd2Q7JJ13 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms