Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms