Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmed3Q78IS1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms