Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usmg5Q78IK2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms