Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stambpl1Q76N33 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stambpl1Q76N33 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stambpl1Q76N33 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stambpl1Q76N33 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stambpl1Q76N33 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms