Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssh1Q76I79 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms