Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1cQ76I25 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms